Единая Теория Природы раскрывает также одну из самых старых тайн ядерной физики – тайну происхождения почти незаметной разности масс протона и нейтрона. Все знают, что эта разность есть, а почему она существует – не знает никто.

Установленный Единой Теорией Природы механизм образования нейтронной звезды показывает, что протон и нейтрон образуются в весьма близких, но не одинаковых условиях (смотри "Откуда взялись нейтроны» в абзаце «Около ядра…»). Слои уплотнённого эфира звезды, в которых образовались протон и нейтрон, располагаются в ядре звезды по соседству. Слой, в котором возник протон, расположен снаружи слоя, в котором образовался нейтрон. Соответственно разность плотности эфира в этих слоях будет незначительная, определяемая толщиной слоя, то есть – размером микровихря (нуклона). Данные условия приводят  нейтрон к несколько большей массе, чем протон. Кроме того, разные условия образования протона и нейтрона приводят и к разной их внутренней структуре (смотри выше «Откуда взялись нейтроны»).

Таким образом, впервые в науке раскрыта тайна разной массы протона и нейтрона и, соответственно – причина, почему протон и нейтрон не являются близнецами, а только двойняшками. Раскрытие этой тайны Природы, даёт новые возможности современной ядерной инженерии. Из всего, приведенного выше, вытекает также следующее. С одной стороны, объяснение природы разности масс протона и нейтрона получено на основе Единой Теории. С другой стороны, указанная разность масс является фактом. Отсюда следует, что этот известный в науке факт подтверждает истинность установленного Единой Теорией механизма возникновения во Вселенной протонов и нейтронов (смотри выше «Откуда взялись нейтроны).